Tuesday, June 3, 2014

La thèse de Sylvie Stucki: Développement d'outils de géo-calcul haute performance


Thesis presentation of Sylvie Stucki:  Development of high performance geo-calculation tools for the identification of regions of the genome potentially under natural selection:  Spatial analysis of the diversity of panels of nucleotide polymorphisms at high density (800k) of Bos Taurus and B. indicus in Uganda.

Synopsis of the presentation:

The genomic environmental study of local adaptation of plants and animals in relation to their habitats.  With the refinement of sequencing techniques, the number of genetic markers available to researchers has considerably increased.  In this context, this presentation will focus on the detection of natural selection in bovines in Uganda and present development tools in environmental genomics and geospatial statistics.

The presentation starts about 10 minutes into the youtube video and is 50 minutes long.  Slides are in French and English.  As part of the presentation, Sylvie gives an excellent short summary of the history of the development of genetics, population genetics and genomics.  She then discusses her research.  After the thesis presentation, her advisor, Stéphane Joost, discusses the development of the research and the NEXTGEN Consortium and then gives an amusing presentation.


La thèse de Sylvie Stucki:  Développement d'outils de géo-calcul haute performance pour l'identification de régions du génome potentiellement soumises à la sélection naturel:  Analyse spatiale de la diversité de panels de polymorphismes nucléotidiques à haute densité (800k) chez Bos taurus et B. indicus en Ouganda

Résumé de la presentation:

La génomique environnementale étudie l'adaptation locale des plantes et des animaux en relation avec leur habitat. Grâce au perfectionnement des techniques de séquençage, le nombre de marqueurs génétiques à la disposition des chercheurs a considérablement augmenté. Dans ce contexte, l'exposé s'articulera autour de la détection de la sélection naturelle chez les bovins ougandais et présentera les outils développés en génomique environnementale et statistiques spatiales.

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